
近日,无锡医科综合大学一号付属医疗机构王学浩科学院院士的团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶点能力代谢转化检测分析服务。
日文关键词:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕文章标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
玩家基层单位:南京医科大学
研究分析材料:细胞
拜谱作为服务性:转录组测序+血清互作组+靶向治疗电能代谢率组
技術线路:
研究方案可是
01、YBX1被技术鉴定为HCC中糖酵解的重中之重DNA
本设计采集工具HCC淋巴癌肿范本(n=7)的单生殖上皮癌细胞RNA测序数剧集采取数据库探讨一下,会发现糖酵解活性酶类主要的聚集在淋巴癌肿生殖上皮癌细胞中,hdWGCNA数据库探讨一下甄别出9个基因组模块电源(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的生存模式模式数据库探讨一下认定YBX1为自主生存模式模式危险 问题(图1H)。进那步结合在一起IHC、WB實驗和淋巴癌肿集体与临近非淋巴癌肿集体的范围转录组学数剧集否认YBX1是肝生殖上皮癌细胞癌调理的内在的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被来确定为缓解HCC細胞糖酵解的核心条件
02、YBX1增进HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点激光能量基础代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有利于促进HCC中的有氧糖酵解和繁殖
03、OGT与YBX1组合并提高YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,淀粉酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合起来并可以淡化YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化开展其磷硝化作用,可以有利于促进其核转位
逐渐一个脚印加测YBX1的O-GlcNAc糖基化有没作用其磷碱化,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT遏药物制剂OSMI-1加工解决,YBX1血清酶水准重要大幅度降低,YBX1磷碱化重要提高(图4A-C)。IP科学实验凸显,在一样的Flag-YBX1底物水准下,YBX1-WT的磷碱化水准重要不低于YBX1-T57A,反映出磷碱化的增大这样不并不仅仅是鉴于高的YBX1血清酶传达(图4D)。隔离了核和质酚类化合物遇到TMG加工解决的HCC神经元中YBX1核传达的提高(图4E-F),逐渐一个脚印遇到YBX1磷碱化的关键因素调因素是AKT(图4G-I)。哪些遇到特别指出O-GlcNAc糖基化依据促使其磷碱化来开展YBX1血清酶稳定可靠性并促使核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 淡化有帮助于其进1步进行磷过酸淡化并才能加速其核转位
05、YBX1带动PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1推动PKM2转录
06、YBX1 要改善组血清乳碱化绘制能力
设计发掘YBX1敲低特殊变低球核苷酸乳碱化,特别是在是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解促使剂2-DG的试验得知了糖酵解与组球核蛋白乳碱化的随时关联性,促使糖酵解可特殊变低H3K18la平行(图6D)。PKM2过表答可逆反应转YBX1敲低导致的的H3K18la越来越低,之外源乳酸处置往往增加H3K18la,还伴着YBX1表答调涨,提升存在着正面反映(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR得知,H3K18la根据含有于YBX1启动时子随时明显增强其转录,该时受O-GlcNAc糖基化国家宏观调控(图6H-J),潜在掘P300 调涨是YBX1明显增强H3K18乳酰化为用的长效机制(图6K-L)。
图6.YBX1怎强H3K18乳硝化作用修饰语水平方向
原创文章总结
在这方面理论研究中有关资料了YBX1在HCC中高传达,另外与糖酵揭秘切相应的。YBX1在T57处被O-GlcNAc展现,导致稳定性高蛋清质并加入其传达。本身展现还有利于会YBX1在T57处的磷硝化作用,有利于会其核易位。以至于,某一工作加强了糖酵解相应的人类基因遗传的转录并畅快乳酸的形成。显然,YBX1刺激P300的转录,以求驱程组蛋清的乳硝化作用,特别的是H3K18la,H3K18乳硝化作用正在向调整YBX1人类基因遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传基因正反面馈环原则图
拜谱个人总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱微生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向治疗势能排泄组技术服务,拜谱菌物建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、译为后掩盖组学、代谢率组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
借鉴文献综述
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.