
2024年9月由上海林业大学生张万刚硕士生导师组织在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物体为该研究提供了亚硝基化绘制组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
汉语宝贝标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2028年影晌指数:5.7
撤稿时刻:2024年9月
潜在客户计量单位:南京农业大学
深入分析文件:蛋白
拜谱提供数据技术性:亚硝基化修饰组学
工艺线路:
一、钻研的结果
01.Caspase-3渗透性
当前尚不清NO对caspase-3的可以抑制造用有没能归因于NO介导的S-亚硝基化,差异溶液浓度系数的GSNO最为外源性NO生产,以诱发caspase-3的身体外S-亚硝基化。結果是因为,与没能GSNO的组相较于,100、200和400μM GSNO组的caspase-3催化抗逆性相关系数缩减(图1),与原本曝光一样的。GSNO外理缩减caspase-3催化抗逆性的不确定原因仍存在不足确立。
图1 其他渗透压的GSNO除理对caspase-3可溶性的影向
02.Caspase-3的S-亚硝基化层度
实验Caspase-3的亚硝基化的数量,以揭示GSNO对Caspase-3的时有发生反应性。经GSNO正确处理后,在线验测到caspase-3淀粉酶S-亚硝基化数量增大(图2)。以上后果呈现,外源性GSNO的培养可成功的 引发caspase-3的身体S-亚硝基化。引人吃惊的是,在都没有GSNO具有的照表组中在线验测到一位暗淡的S-亚硝基化带,这呈现caspase-3将时有发生内源性的S-亚硝基化。虽然,本实验中caspase-3的S-亚硝基化的数量较高,而caspase-3的活力性变低,这与先前的实验不同。不过,caspase-3的特男人S-亚硝基化淡化位点尚不明白,还必须要 进的一步的科学探索。
图2 GSNO操作对caspase-3S-亚硝基化层次的关系
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化修饰语组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。深蓝色记号的字段认为S-亚硝基化肽,颜色记号的C认为S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3溶解结蛋白质
结球球核核核淀粉酶酶酶作为一个是一种主要性的人体细胞膜骨架球球核核核淀粉酶酶酶,在提升肌人体细胞膜形式的形式独立性性和膨胀性方位起注主要性使用,探究S-亚硝基化caspase-3对结球球核核核淀粉酶酶酶溶解的明情绪化都包括主要性寓意。与Std(未用胱天球球核核核淀粉酶酶酶酶-3和GSNO孵育的刚开始肌纤维素素球球核核核淀粉酶酶酶)组相比之下,0 μM GSNO组(肌原纤维素素和caspase-3的孵育,无GSNO)的独立性结球球核核核淀粉酶酶酶成分更为清晰影响,显示caspase-3对结球球核核核淀粉酶酶酶都包括风险的球球核核核淀粉酶酶酶核球蛋白酶质水解学习能力。在GSNO孵育后,独立性结球球核核核淀粉酶酶酶的成分清晰增长(P < 0.05)。还有就是,当GSNO渗透压增大时,独立性结球球核核核淀粉酶酶酶的成分持续性调涨(P < 0.05)(图5)。这样发觉证实,SNO表达的caspase-3以平行依赖症的方试可抑制结球球核核核淀粉酶酶酶的溶解。
图5.S-亚硝基化caspase-3降解塑料结球蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3可降解肌钙蛋白质-T
肌钙血清-T (TnT)是原肌球血清调低承担责任肌肉群缩紧的细条的一定肌原玻纤棉血清。TnT的化学挥发的特征是检侧到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化條件下,caspase-3对TnT的化学挥发前提如图所示6如图所示,与Std组(可含caspase-3和GSNO的肌原玻纤棉)好于,caspase-3组中30 kDa TnT细节描写看不出增高,表达caspase-3参与活动了TnT的化学挥发,除外,caspase-3与GSNO的孵育产生30 kDa TnT回落。在100和200 μM GSNO组间如果没有检侧到看不出的差异化(P > 0.05),而当GSNO的密度提高400 μM 时,该细节描写看不出缩减(P < 0.05)。这样找到表达了SNO掩盖的caspase-3对TnT化学挥发的治理和改善功能。结血清和TnT是caspase-3的特别敏感底物,而GSNO治理 调低caspase-3的亲水性酶类也许产生肌原玻纤棉血清化学挥发因素调低。由此可见根据上述,NO引诱的S-亚硝基化能否按照掩盖半胱氨酸残基来调低caspase-3的亲水性酶类,若想下一步骤不良导致其对结血清和TnT的血清电离力量,若想不良导致牛羊肉品性。
图6. S-亚硝基化caspase- 3挥发肌钙血清-T
二、总结ppt
本科学研究有赖于一起探讨S-亚硝基化对caspase-3绘制的不良不良影响举例说明马上又对牛羊肉肌原植物仟维离体溶解的不良不良影响。血清酶S-亚硝基化行绘制caspase-3的半胱氨酸残基,进而从而导致caspase-3生物消减,进一点遏制了其对牛羊肉肌原植物仟维血清酶的血清酶水解反应效果。三、拜谱工作小结
论述选择了酶活测试,亚硝基化装饰组学了解,WB等测试的方法,会发现球血清酶S-亚硝基化需要装饰caspase-3的半胱氨酸残基,这形成了caspase-3灵活性的变低,并举的一步限制了其对羊肉肌原食物纤维球血清酶的球血清酶电离学习能力。本论述为解读球血清酶质亚硝基化对肉肥的改善系统展示 没事个新的第一人称视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的胆固醇质组学、绘制胆固醇质组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系成品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total腐蚀恢复备份、氧化钙含量巯基,欢迎大家咨询!
分类期刊论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663