
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱怪物 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究分析的结果
设计员探讨根据保温事件变长牛羊肉的硬性、持混流式水轮机、光色、徘徊铁的量、ROS、脂质过空气铁的氧化物、MDA、GSH和GPX4情况来估评脂肪团体体血细胞的铁窒息死亡心态。最终体现,保温事件变长后,牛羊肉的硬性在第六天和第6天相关性大幅度降低;持水本事大幅度降低;字体颜色变深,有了金属光泽,鲜灰色变成暗灰色。前者,徘徊铁、化学活化氧和MDA的的量相关性增长,体血细胞凋亡率相关性身高。 理论研究人转化成区别保鲜时长的肌群样本管理的球高血清,进而完成SDS-PAGE研究研究分析,球高血清条带在区别期间分布图制作均衡且同类(图1a)。不同的球血清在区别样本管理中的展现情况发生,研究研究分析看见同时组样本管理的中个数靠近于同时关卡(图1b),阐述肌群样本管理球高血清具备着稳定的组内同类性和组间差别的性。 球蛋清质含量组学共认定出1996种球蛋清质含量。以B0为相较比较组,建立B1、B2、B4和B6中的球蛋清通过差距展示了解,共认定到374个DEPs。将火山图交互式,并按照其FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两标淮了解DEP。但是如图已知1c-f右图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别认定出22、33、73和140个DEPs,这其中分发型别上浮6、11、32和8八个,降低16、22、41和5俩。聚类分析法具体方法测试了不相同冷藏箱步骤肩部胸肌组织机构中球蛋清质含量的展示,但是现示肩部胸肌球蛋清展示差距跟随着贮存时间间隔的增高而增高(图1g)。
图1| 有差异食品冷藏時间的肌肉群备样蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 其他食品冷藏时间段的背部肌肉仿品差异化球蛋白分享(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁枯死蛋白酶肽的PRM降钙素原检测分享(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 鉴于KEGG丰度地域差异抒发蛋白质的铁身故系统(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物体提供了TMT按量核高蛋白酶组学能力售后功能,拜谱生态学已新类产品研发完全并建设了完整成孰的转录组学、核蛋白酶组学、分解组学还有几组学聯合类产品能力售后功能管理体系,欢迎致电咨询!
参考使用专著:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.